Genomics & Gene Engineering
ユニーテックTOP > 【Genomics & Gene Engineering】 - DNA Sequence / SNPs解析 / リアルタイムPCR解析

DNA Sequence

凍結切片やホルマリン固定パラフィン包埋切片からのダイレクトシークエンスも可能!

これまで蓄積されたお持ちの貴重なサンプルを有効にご活用いただけます。

さまざまなアプリケーションを準備しております。

・未知のSNPs探索
・ガンなどによるゲノムのリアレンジメント
・メチル化解析
遺伝子配列の決定のみならず、さまざまな解析オプションを準備して、幅広いニーズにお答えします。

遺伝子情報とサンプルをご提供いただくだけ!

ゲノムDNAやプラスミド抽出、プライマー設計から配列データの提出まで、一連の作業をまとめてご依頼いただけます!

どのステップからでもご依頼可能!

お手持ちのサンプルや予算に応じて、どの段階からでも受託可能な環境を準備しております。

外部に検索履歴を残さず、お客様の配列情報を高度に保護

バイオインフォマティクスを専門とする研究員が社内にダウンロードしたデータベースを使用し、各種シークエンス解析を行います。

最短でサンプル受領後24時間または48時間以内に結果の速報をEメールでお送りします。

ダイレクトシーケンスとプラスミドシーケンス、納品までの流れ

ご送付いただくサンプルを示しています。
ダイレクトシークエンス
※500bp以下を1単位(1region)としてシークエンスします。
ゲノムのシークエンス、SNPs解析等にご使用頂けます。
上記のシークエンス反応・解析料金に加えて、PCR産物作製精製が必要となります。

ご提供いただくもの

  濃度 total 輸送温度
組織・凍結切片・ホルマリン固定パラフィン包埋切片・培養細胞など ご相談ください
ゲノムDNA溶液 50ng/μl 以上 100μl 以上 5μg 以上 4℃
PCRproduct(未精製) PCR反応液 50μl 以上   -20℃
PCRproduct(カラム精製済) 50ng/μl 以上 20μl 以上 1μg 以上 -20℃

価格

試験内容 価格
PCRproduct作製 2,000円/region
PCRproduct精製 600円/sample
プライマー設計・合成 4,000円/1本
プラスミドシークエンス
※500bp以下を1単位(1region)としてシークエンスします。
プラスミドなどにクローニングされたものをシークエンス致します。
ベクターインサート配列の確認・クローンの同定にご使用下さい。

ご提供いただくもの

  濃度 total 輸送温度
プラスミドDNA溶液 300ng/μl 以上 20μl 以上

5μg 以上

-20℃
コロニー/グリセロールストック ご相談ください

価格

試験内容 価格
コロニーPCR+
PCRproduct精製
2,000円/colony
プラスミド抽出 2,000円/sample
プライマー設計・合成 4,000円/1本

シークエンス反応料金

総反応数 1~38反応 2,000円/sequence
総反応数 39~96反応 76,800円(定額)
総反応数 97反応以上 800円/sequence
大規模シークエンス(総反応数10plate以上) お問い合わせください

その他、ご希望により提供いただくもの

  濃度 total 輸送温度
シークエンスプライマー 10pmol/μl 10μl 以上   -20℃
※解析するサンプル数により変化する場合がございますので、あらかじめお問い合わせ下さい。
※お預かりしたサンプルは原則としてご返送しません。ご返送が必要な場合には、あらかじめご連絡下さい。
※各サンプルは上記の指定の温度で、送料着払いにてご発送下さい。

納品物

Eメールによる報告書提出  
CD-ROM 配列テキストデータ
.ab1ファイル(PDFも可)
解析データ(contig,alignmentなど)

価格計算例

※500bpを1単位(1 region)としてシークエンスします。
ゲノムDNA 3kbpをターゲットとして、3検体(ゲノムDNA)をダイレクトシークエンスでForward/Reverseから解析する場合
1) シークエンス単位を決定 3000bp÷500bp=6region
2) プライマーの設計合成料金 6region×2本(F/R)×4,000円=48,000円
3) PCR product作製・精製料金 6region×3検体×2,600円=46,800円
4) シークエンス反応料金 6region×2本(F/R)×3検体×2,000円=72,000円
  合計166,800円

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SNPs解析

専用のソフトウェアと研究員の目でダブルチェック!

解析ソフトウェアによる客観的なSNP判定に加えて、3名以上の研究員による目視での波形チェックにより、SNPの誤判定・取りこぼしを2重に防止しております。
ダイレクトシークエンスによるSNPs解析だから
  • 凍結切片やホルマリン固定、パラフィン包埋切片、唾液からの解析も可能。
  • 未知のSNPs探索に対応が可能。
  • SSCP法などとは異なり、DNA配列をダイレクトに検出するため非常に正確。
  • 抽出した全てのSNPに対して再現性確認試験を行い、アーティファクトを排除。

ご提供いただくもの

  濃度 total
ゲノムDNA溶液 50ng/μl 以上 100μl 以上 5μg 以上
組織(凍結切片やホルマリン固定・唾液・パラフィン包埋切片を含む)・培養細胞 お問い合わせ下さい

SNPs解析価格

シークエンス解析料金 ダイレクトシークエンスをご参照下さい※
SNPs解析判定料金 1,800円/1region(1region=500bp)
※SNP解析では、基本的に両鎖(Forward,Reverse)解析を行いますので、1regionにつき2シークエンス反応を行います。

納品物

SNPs解析報告書  
解析データ 標準配列などとのアライメント等
生データ .ab1ファイル
波形データの出力
塩基配列テキストデータ

お手持ちのホルマリン
固定パラフィン包埋組織(FFPE)

FFPE組織から抽出したDNAは、
抽出PCRが非常に困難

ユニーテック

ユニーテックでは豊富な経験と実績に基づき、独自に拡散の抽出条件を定めることが出来ました。更に、プライマー設計を含む的確なPCRの条件設定で、確実に標的遺伝子を増幅し、SNP解析を可能にします。

リアルタイムPCR解析

国家プロジェクトからフィードバックされた豊富な経験と確かな技術!

リアルタイムPCRはどんなに優れた最新の装置を導入しても、再現性のある安定したデータを得るためには、熟練した経験・技術に基づく条件設定が必要となります。ユニーテック(株)では、経験豊富な研究員による緻密な条件設定の下で、SYBR Greenを用いたインターカレーション法により、目的遺伝子の発現レベルを定量的に測定いたします。高価な装置を導入するよりも、ぜひユニーテック(株)をご活用下さい!

低コストと高い再現性・高い信頼性を実現!
ユニーテック独自のPCR genotyping技術を応用した非常に特異性の高いPCRに、低コストで汎用性の高いSYBR Greenを組み合わせることで、TaqMan probeをもしのぐ高い再現性と信頼性を実現しました。

ご提供いただくもの

精製済みRNAもしくは対象となる組織・培養細胞
(RNA抽出につきましては、RNA抽出をご参照ください)

リアルタイムPCR解析価格

プライマー設計・合成(4本) 16,000円/1gene
cDNA合成 13,000円/1検体
基本解析料金 80,000円/1gene
35,000円/1内部標準
リアルタイムPCR(SYBR Green) 4,300円/1反応(n=1※)
※任意の n数で受託いたします。n=2のとき、8,600円/1反応となります。

納品物

遺伝子発現報告書
生データ

異なる飼料を摂取させたマウスにおける遺伝子Aの発現レベル

弊社受託例
異なる飼料を摂取させたマウスにおける遺伝子Aの発現レベル
・・・異なる飼料を摂取させたマウス(Group B,n=8)における遺伝子Aの発現レベルは、コントロール群(Group A)と比較して増加していることが明確に確認できた。
(遺伝子の発現レベルが変動する動物実験)
 

外来遺伝子Bの全身発現Transgenic mouseにおける各臓器の遺伝子B発現レベル

弊社社内試験
外来遺伝子Bの全身発現Transgenic mouseにおける各臓器の遺伝子B発現レベル
・・・外来遺伝子Bを全身発現するTransgenic mouse(弊社にて設計・作製)について各臓器における発現を解析した。解析を行った全ての臓器(12組織)において遺伝子Bの発現が確認された。
(Transgenic mouseの発現確認試験)

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